Haplotipos mitocondriales de Phytophthora andina de tomate de árbol en el Ecuador

  • María Eugenia Ordoñez PUCE
Palabras clave: Haplotipo mitocondrial, Phytophthora andina, Solanum betaceum

Resumen

Se determinó el haplotipo mitocondrial de 131 aislamientos puros de Phytophthora andina colectados de tomate de árbol (Solanum betaceum) en varias provincias del Ecuador.  Se amplificaron las regiones P2 y P4 del ADNmt, y los productos de PCR obtenidos fueron digeridos con las enzimas de restricción MspI y EcoRI. Todos los aislamientos analizados mostraron un patrón de bandas correspondiente al haplotipo Ia para P. infestans, es decir, bandas de tamaño 720 y 350 pb con MspI (región P2) y bandas de tamaño 394, 361 y 309 pb con EcoRI (región P4). Sin embargo, también se observó de forma consistente en todos los aislamientos analizados bandas adicionales que no han sido reportadas anteriormente. Para la región P2 se obtuvieron bandas adicionales de 400 y 500 pb y un fragmento no digerido de 1070 pb, y para la región P4 bandas adicionales de 603 y 755 pb además de un fragmento no digerido de 964 pb. El encontrar un patrón nuevo de bandas de manera consistente para todos los aislamientos de P. andina analizados sugiere que la descripción del haplotipo Ia asignado a P. andina de tomate de árbol debería ser redefinido.

Citas

Adler NE, Erselius LJ, Chacon MG, Flier WG, Ordoñez ME, et al. 2004. Genetic diversity of Phytophthora infestans sensu lato in Ecuador provides new insight into the origin of this important plant pathogen. Phytopathology. 94:154–162.

Blair JE, Coffey MD, Martin FN. 2012. Species tree estimation for the late blight pathogen, Phytophthora infestans, and close relatives. PLoS One. 7, e37003.

Bohs L. 2007. Phylogeny of the Cyphomandra Clade of the Genus Solanum (Solanaceae) Based on ITS Sequence Data. Taxon. 56(4):1012. doi:10.2307/25065901

Caten C, Jinks J. 1968. Spontaneous variability of single isolates of Phytophthora infestans. I. Cultural variation. Canadian Journal of Botany. 46(4):329-348. https://doi.org/10.1139/b68-055

Carter DA, Archer SA, Buck KW. 1990. Restriction fragment length polymorphisms of mitochondrial DNA of Phytophthora infestans. Mycol. Res. 94:1123-1128.

Chacón Acosta MG. 2007. Variability of Phytophthora infestans sensu lato in the highland tropics of Ecuador. Zurich, Switzerland: Swiss Federal Institute of Technology Zurich, PhD thesis.

Encuesta de Superficie y Producción Agropecuaria Continua - ESPAC 2016. (2016). Instituto Nacional de Estadística y Censos – INEC. Recuperado de: http://www.ecuadorencifras.gob.ec/estadisticas-agropecuarias-2/

Flier WG, Grunwald NJ, Kroon LPNM, van den Bosch GBM, Garay-Serrano E, et al. 2002 Phytophthora ipomoeae sp. nov., a new homothallic species causing leaf blight on Ipomoea longipedunculata in the Toluca Valley of central Mexico. Mycological Research. 106:848-856.

Forbes GA, Ristaino JB, Oliva RF, Flier W. 2012. A rebuttal to the letter to the editor concerning ‘Defining species boundaries in the genus Phytophthora: the case of Phytophthora andina’. Plant Pathology. 61:221–223.

Forbes GA, Morales JG, Restrepo S, et al. 2013. Phytophthora infestans and Phytophthora andina on Solanaceous hosts in South America. In: Lamour K (ed), Phytophthora: a global perspective: 48–58. CABI Plant Protection Series, No. 2, UK.

Forbes GA, Gamboa S, Lindqvist-Kreuze H, Oliva RF, Perez W. 2016. Identification of an A2 population of Phythophthora andina attacking tree tomato in Peru indicates a risk of sexual reproduction in this pathosystem. Plant Pathology. 65(7):1109-1117. doi:10.1111/ppa.12531

Galindo J, Hohl HR. 1985. Phytophthora mirabilis, a new species of Phytophthora. Sydowia 38:87-96.

Gomez-Alpizar L, Hu CH, Oliva R, et al. 2008. Phylogenetic relationships of Phytophthora andina, a new species from the highlands of Ecuador that is closely related to the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans. Mycologia. 100:590–602.

Goss EM, Cardenas ME, Myers K, et al. 2011. The plant pathogen Phytophthora andina emerged via hybridization of an unknown Phytophthora species and the Irish potato famine pathogen, P. infestans. PLoS One. 6:e24543.

Griffith GW, Shaw DS. 1998. Polymorphism in Phytophthora infestans: Four mitochondrial haplotypes are detected after PCR amplification of DNA from pure cultures or from host lesions. Applied and Environmental Microbiology. 64(10):4007-4014.

Kroon L, Bakker F, Van den Bosch G, Bonants P, Flier W. 2004. Phylogenetic analysis of Phytophthora species based on mitochondrial and nuclear DNA sequences. Fungal Genetics and Biology. 41(8):766-782. doi:10.1016/j.fgb.2004.03.007

Martin FN, Blair JE, Coffey MD. 2014. A combined mitochondrial and nuclear multilocus phylogeny of the genus Phytophthora. Fungal Genetics and Biology. 66: 9–32.

Martin MD, Vieira FG, et al. 2015. Genomic characterization of a South American Phytophthora hybrid mandates reassessment of the geographic origins of Phytophthora infestans. Mol. Biol. Evo. 33(2):479-491. doi:10.1093/molbev/msv241

Martin, F. N., Zhang, Y., Cooke, D. E., Coffey, M. D., Grünwald, N. J., Fry, W. E. 2019. Insights into evolving global populations of Phytophthora infestans via new complementary mtDNA haplotype markers and nuclear SSRs. PloS One. 14(1), e0208606.

Mideros MF, Turissini DA, Guayazán N, Ibarra-Avila H, Danies G, et al. 2018. Phytophthora betacei, a new species within Phytophthora clade 1c causing late blight on Solanum betaceum in Colombia. Persoonia: Molecular phylogeny and evolution of fungi. 41:39-55.

Morales J. 2002. Diagnóstico agro socio económico del cultivo de tomate de árbol (Solanum betacea Sendt.) en cuatro provincias de la sierra ecuatoriana (Imbabura, Pichincha, Tungurahua y Azuay). Tesis de Grado Universidad Central del Ecuador. Facultad de Ciencias Agrícolas.

Oliva RF, Kroon LPNM, Chacón G, et al. 2010. Phytophthora andina sp. nov., a newly identified heterothallic pathogen of solanaceous hosts in the Andean highlands. Plant Pathology 59:613–625.

Ordoñez ME, Hohl HR, Velasco JA, Ramon MP, Oyarzun PJ, et al. 2000. A novel population of Phytophthora, similar to P. infestans, attacks wild Solanum species in Ecuador. Phytopathology. 90:197-202. doi:10.1094/PHYTO.2000.90.2.197.

Revelo J, Mora E, Reyes M. 2004a. Comportamiento de genotipos comerciales de tomate de árbol a las enfermedades nudo de la raíz, antracnosis del fruto, tizón tardío y mancha negra del tronco. Plegable de divulgación No. 228. INIAP, Promsa.

Revelo J, Pérez E, Maila MV. 2004b. Cultivo ecológico del tomate de árbol en Ecuador: Texto de consulta del estudiante. Quito, Ecuador: INIAP, Estación Experimental Santa Catalina/PROMSA/FONTAGRO.

Waterhouse GM. 1963. Key to the species of Phytophthora de Bary. Mycological Papers. 92:22.
Publicado
2019-11-18
Sección
Notas científicas