Identificación de islas CpG en el genoma humano a través de las cadenas de Markov: Un modelo matemático basado en probabilidades.

Contenido principal del artículo

Evelyn Quishpe
María Eugenia Sánchez
Gabriela Oleas de la Carrera
César Paz y Miño

Resumen

Los genes de importancia biológica conocidos como genes esenciales de mantenimiento o housekeeping genes suelen encontrarse rodeados por regiones denominadas Islas CpG, llamadas asàdebido a que contienen una cantidad mucho mayor de dinueleótidos CpG que el resto del genoma y, ya que del reconocimiento de tales islas se puede inferir la ubicación de los housekeeping genes, un modelo matemático de identificación de Islas CpG facilitaría su diferenciación del resto del genoma. El modelo matemático que se presenta en este artículo toma como ejemplo a una secuencia de 60 nucleótidos presente en el genoma del parvovirus canino y se basa en las cadenas de Markov para calcular la probabilidad de que un fragmento de dicha secuencia, en relación al resto de ella, corresponda o no a una Isla CpG. Este modelo puede ser utilizado en cualquier secuencia, independientemente de su número de nucleótidos sin embargo, la del parvovirus, escogida en este caso como una pequeña muestra de ejemplificación. sirvió para comparar y confirmar por simple inspección los resultados

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Detalles del artículo

Cómo citar
1.
Quishpe E, Sánchez ME, Oleas de la Carrera G, Paz y Miño C. Identificación de islas CpG en el genoma humano a través de las cadenas de Markov: Un modelo matemático basado en probabilidades. REMCB [Internet]. 8 de agosto de 2017 [citado 28 de marzo de 2024];27(1-2):43-6. Disponible en: https://remcb-puce.edu.ec/remcb/article/view/192
Sección
Artículos Científicos

Citas

LEWIN, B. GENES vn Ed. Marbán, Madrid 2001. página 682.
http://www.itlp.edu.mxIpublicaltutoriales/in­vestoper2/tema43.htm

NCBI. Nucleotide sequence and genome or­ ganization of canine parvovirus (Banco de Datos-secuencias de AND). www.ncbi.hlm­ .nih. gov/entreziqueIY.fcgi?

KARLIN, S. A First Course in Stochastres Processes. USA. 1975 Academic. Press. Pags. 58-59. Revista Ecuatoriana de Medicina yCiencias Biológicas -Vol. xxvn Números 1 y2: 46-46. octubre del 2005 o

Artículos más leídos del mismo autor/a