Identificación de islas CpG en el genoma humano a través de las cadenas de Markov: Un modelo matemático basado en probabilidades.

  • Evelyn Quishpe
  • María Eugenia Sánchez
  • Gabriela Oleas de la Carrera
  • César Paz y Miño
Palabras clave: Cadenas de Markov, Islas CpG, Hosekeeping genes

Resumen

Los genes de importancia biológica conocidos como genes esenciales de mantenimiento o housekeeping genes suelen encontrarse rodeados por regiones denominadas Islas CpG, llamadas asàdebido a que contienen una cantidad mucho mayor de dinueleótidos CpG que el resto del genoma y, ya que del reconocimiento de tales islas se puede inferir la ubicación de los housekeeping genes, un modelo matemático de identificación de Islas CpG facilitaría su diferenciación del resto del genoma. El modelo matemático que se presenta en este artículo toma como ejemplo a una secuencia de 60 nucleótidos presente en el genoma del parvovirus canino y se basa en las cadenas de Markov para calcular la probabilidad de que un fragmento de dicha secuencia, en relación al resto de ella, corresponda o no a una Isla CpG. Este modelo puede ser utilizado en cualquier secuencia, independientemente de su número de nucleótidos sin embargo, la del parvovirus, escogida en este caso como una pequeña muestra de ejemplificación. sirvió para comparar y confirmar por simple inspección los resultados

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Publicado
2017-08-08
Sección
Artículos Científicos